В целом внимание к археологическим ценностям находилось подчеркнуто как яркая сторона проекта. Находки на месте изысканий планировалось представить в музее, который довольно основан в уже построенном комплексе.  ОДЦ «Охта-Центр» размещал информацию о том, что кроме службы археологической экспедиции привлекается  помощь еще полного ряда экспертов.  Так, для исследования структуры грунтов в зоне предполагаемого строительства «Охта центра» были проведены редкие геологоразведочные работы. Специалисты пробурили 200 скважин на глубину 75 и 175 метров, что не владеет прецедентов в строительной индустрии в России. Также на территории грядущего «Охта центра» проводились геофизические, топографические, гидрометеорологические, сейсмологические и экологические проведение исследования, бурения и обследования образцов почв и глин.  Инженерные исследования выполняли 13 высококвалифицированных исследовательских организаций в службе строительства и геологии, среди тот или другой всероссийские и санкт-петербургские научно-исследовательские установления. Коса нашла на камень именно с НИИ «Наследие», которое выполнило почти все оговоренные контрактом службы, но заказчик остановил эту труд  и затребовал документацию в полном объеме. По информации раза из крупных деловых петербургских изданий, археологи отказались  предоставить  полную документацию, не кончив работы. И в результате застройщики  «Охта Центра» подали иск к НИИ на 29,5 млн рублевок.  Акт должен был к тому же содержать пункт о общности НИИ на строительство в данном месте, но археологи не даровали пока такого согласия. Более того, НИИ «Наследие» собирается подать встречный иск о взимании предоплаты. Ряд экспертов видит в этом инциденте просто внутренний деловой спор плохо компаний, в то время как другие предполагают, что  это попытка давления на знатоков, чье мнение потом может быть применено при принятии окончательного решения о строительстве – в высоких инстанциях.